Multilocus Sequence Typing of Group A Streptococci Isolatedfrom Invasive Diseases in the Czech Republic in 2003
Multilokusová sekvenační typizace streptokokůskupiny A izolovaných z invazivních onemocněnív České republice v roce 2003
V článku jsou prezentovány první výsledky charakterizace 29 invazivních kmenů Streptococcuspyogenes, izolovaných v České republice v první polovině roku 2003, metodou multilokusové sekvenačnítypizace (MLST). U žádného z 16 přítomných emm typů nebyla mezi kmeny našeho souboruzjištěna variabilita sekvenčních typů (ST). První výsledky MLST ukazují, že populace kmenůzpůsobujících závažná onemocnění v České republice je odlišná od kmenů izolovaných v zahraničí.U sedmi kmenů byly popsány nové sekvenční typy: ST134, ST308, ST336, 5T340, obsahující novékombinace známých alel a ST341 se třemi dosud nepopsanými alelami (gki 91, murI 65 a yqiL 60),zjištěný u třech kmenů. Nově popsané sekvenční typy byly registrovány v celosvětové databáziMLST S. pyogenes.
Klíčová slova:
invazivní GAS – klonální analýza – MLST – streptokok.
Authors:
L. Straková; P. Křížová
Authors place of work:
Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha
Published in the journal:
Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. , 2004, č. 4, s. 190-193
Category:
Summary
First results of multilocus sequence typing (MLST) for characterization of 29 invasive Streptococcuspyogenes strains isolated in the Czech Republic in the first half of 2003 are presented. None of 16emm types detected among the study strains showed sequence type (ST) variability. The MLSTresults are indicative of differences between the strains causing serious diseases in the CzechRepublic and those isolated in other countries. In seven strains, four new STs with known alleles innew combinations, ST134, ST308, ST336, ST340, and one new ST with three as yet undescribed alleles(gki 91, murI 65 and yqiL 60), ST341, were described. These newly described STs were submitted tothe web-based reference MLST database for S. pyogenes.
Key words:
invasive group A streptococci – clonal analysis – MLST – streptococcus.
Štítky
Hygiene and epidemiology Medical virology Clinical microbiologyČlánok vyšiel v časopise
Epidemiology, Microbiology, Immunology
2004 Číslo 4
Najčítanejšie v tomto čísle
- Multilocus Sequence Typing of Group A Streptococci Isolatedfrom Invasive Diseases in the Czech Republic in 2003
- Resistance to macrolides in the species Streptococcus pyogenes in the Czech Republicin 1996–2003
- External Quality Control System in Medical Microbiologyand Parasitology in the Czech Republic
- Effects of Climate Changeon the Incidence of Tick-borne Encephalitis in the Czech Republic in the Past TwoDecades