Intronové mutace jako příčina hemofilie A
U malé skupiny pacientů s typickým obrazem hemofilie A (HA) není možné nalézt kauzální mutaci v kódující sekvenci pro faktor VIII (FVIII).
U malé skupiny pacientů s typickým obrazem hemofilie A (HA) není možné nalézt kauzální mutaci v kódující sekvenci pro faktor VIII (FVIII). Vědci z německého Bonnu studovali skupinu pacientů s mírnou HA (a pouze s jedním případem středně závažné HA), u kterých nebyla detekovatelná mutace ve FVIII.
U těchto pacientů stanovili aktivitu FVIII a von Willebrandova faktoru (VWF), provedli eseje na stanovení vazby VWF-FVIII (VWF:FVIIIB) a vazby VWF-kolagen (VWF:CB), dále analyzovali VWF multimery. Současně byl kompletně sekvenován gen pro VWF k vyloučení mutace. Lokus pro FVIII zahrnující introny byl sekvenován pomocí long-range PCR (LR-PCR) v kombinaci s přístupem sekvenování nové generace (NGS). Dalším krokem pak byla analýza mRNA FVIII kvantitativní i kvalitativní s využitím PCR v reálném čase (qRT-PCR) a PCR s reverzními transkriptázami (RT-PCR).
Všechny testy na VWF byly normální. LR-PCR metoda ukázala integritu lokusu FVIII. Pro každého pacienta byl prokázán unikátní polymorfismus, s výjimkou dvou, které se opakovaly. Analýza s RT-PCR potvrdila, že dvě z nalezených variant byly spojeny s vytvořením nových míst sestřihu, které byly příčinou vložení intronových DNA sekvencí do mRNA a vytvořily tak nové předčasné stop kodóny.
Tento přístup k hledání mutací ve FVIII ukázal, že některé intronové mutace v genu pro FVIII mohou vzácně působit abnormální tvorbu mRNA, což může být příčinou obrazu mírné HA.
(eza)
Zdroj: Pezeshkpoor B., et al. Deep intronic ‚mutations‘ cause hemophilia A: Application of Next Generation Sequencing in patients without detectable mutation in F8 cDNA. J Thromb Haemost. – publikováno online 29. června 2013; doi: 10.1111/jth.12339.
Páčil sa Vám článok? Radi by ste sa k nemu vyjadrili? Napíšte nám − Vaše názory a postrehy nás zaujímajú. Zverejňovať ich nebudeme, ale radi Vám na ne odpovieme.