Charakterizace kmenů Haemophilus influenzaemetodou multilokusové sekvenační typizace
Charakterizace kmenů Haemophilus influenzaemetodou multilokusové sekvenační typizace
Jsou prezentovány první výsledky charakterizace kmenů Haemophilus influenzae novou metodoumultilokusové sekvenační typizace (MLST). Charakterizace souboru 28 kmenů H. influenzae izolovanýchz invazivních onemocnění v České republice ukázala klonální homogenitu těchto kmenů:z 26 testovaných kmenů H. influenzae b vykazovalo 22 kmenů jednotný sekvenční typ: ST-6. U 4kmenů byly zjištěny námi nově popsané sekvenční typy: ST-83 (3 kmeny) a ST-84 (1 kmen). U 2netypovatelných kmenů H. influenzae byly zjištěny jiné sekvenční typy než ST-6: ST-3 a námi nověpopsaný ST-85. První výsledky MLST ukazují, že ST-6 je typický pro H. influenzae b izolovanéz invazivních onemocnění v České republice. Námi nově popsané sekvenční typy ST-83, ST-84 a ST-85byly registrovány v celosvětové databázi MLST H. influenzae (http://haemophilus.mlst.net).
Klíčová slova:
Haemophilus influenzae – multilokusová sekvenační typizace – klonální analýza –sekvenční typ.
Multilocus SequenceTyping of Haemophilus influenzae Strains
First results of multilocus sequence typing (MLST) of Haemophilus influenzae strains are presented.MLST of 28 H. influenzae strains isolated frompatients with invasive diseases in the Czech Republicis indicative of clonal homogeneity of these strains: 22 out of 26 H. influenzae b strains tested wereof the same sequence type, ST-6. Four strains were of two sequence types newly described in thisstudy: ST-83 (3 strains) and ST-84 (1 strain). Two nontypeable H. influenzae strains were assigned tosequence types other than ST-6: ST-3 and ST-85 newly described in this study. First MLST resultsshow ST-6 to be typical of H. influenzae b isolated from patients with invasive diseases in the CzechRepublic. The sequence types newly described in this study, i.e. ST-83, ST-84 and ST-85, weresubmitted to the worldwide H. influenzae MLST database (http://haemophilus.mlst.net).
Key words:
Haemophilus influenzae – multilocus sequence typing – clonal analysis – sequence type.
Autoři:
P. Křížová 1
; J. Kalmusová 1; V. Lebedová 1; J. Felsberg 2; R. Haugvicová 2
Působiště autorů:
Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha2Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha
1
Vyšlo v časopise:
Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. , 2004, č. 2, s. 74-77
Kategorie:
Články
Souhrn
Jsou prezentovány první výsledky charakterizace kmenů Haemophilus influenzae novou metodoumultilokusové sekvenační typizace (MLST). Charakterizace souboru 28 kmenů H. influenzae izolovanýchz invazivních onemocnění v České republice ukázala klonální homogenitu těchto kmenů:z 26 testovaných kmenů H. influenzae b vykazovalo 22 kmenů jednotný sekvenční typ: ST-6. U 4kmenů byly zjištěny námi nově popsané sekvenční typy: ST-83 (3 kmeny) a ST-84 (1 kmen). U 2netypovatelných kmenů H. influenzae byly zjištěny jiné sekvenční typy než ST-6: ST-3 a námi nověpopsaný ST-85. První výsledky MLST ukazují, že ST-6 je typický pro H. influenzae b izolovanéz invazivních onemocnění v České republice. Námi nově popsané sekvenční typy ST-83, ST-84 a ST-85byly registrovány v celosvětové databázi MLST H. influenzae (http://haemophilus.mlst.net).
Klíčová slova:
Haemophilus influenzae – multilokusová sekvenační typizace – klonální analýza –sekvenční typ.
Štítky
Hygiena a epidemiológia Infekčné lekárstvo MikrobiológiaČlánok vyšiel v časopise
Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie
2004 Číslo 2
- Parazitičtí červi v terapii Crohnovy choroby a dalších zánětlivých autoimunitních onemocnění
- Očkování proti virové hemoragické horečce Ebola experimentální vakcínou rVSVDG-ZEBOV-GP
- Koronavirus hýbe světem: Víte jak se chránit a jak postupovat v případě podezření?
Najčítanejšie v tomto čísle
- Bakteriálne sekrečné systémy typu III a ich vzťahk virulencii
- Genotypy viru hepatitidy B (HBV) v České republice
- Charakterizace kmenů Haemophilus influenzaemetodou multilokusové sekvenační typizace
- Virové hepatitidy u problémových uživatelůnávykových látek v ČR