Application of Restriction Analysis of the Gene for 16S rRNA for Verification of Species Identity in Important Oral Microorganisms I. Viridans Streptococci

České info

Využití restrikční analýzy genu pro 16S rRNA pro ověření druhové identity významných orálních mikroorganismů I. Viridující streptokoky

Je navržen jednoduchý algoritmus analýzy genetického materiálu orálních streptokoků, významně zpřesňující druhovou identifikaci bakterií spjatých s destrukcí tvrdých zubních tkání. Metodika založená na analýze části genu pro 16S rRNA byla laboratorně ověřena pro druhovou identifikaci 87 izolátů orálních streptokoků a správnost výsledků potvrzena metodou absolutní, tj. stanovením DNA sekvence analyzovaného úseku. Využití navrženého postupu je univerzální a analýzu lze rozšířit i o další klinicky významné mikroorganismy ústní dutiny, např. o slizniční bakterie spjaté s onemocněním parodontu. Navržená finančně nenáročná metodika umožňuje jednoznačnou druhovou identifikaci i pro biochemicky obtížně rozlišitelné druhy. Spolehlivě např. odliší streptokoky uvnitř skupiny mutans.

Klíčová slova:
orální streptokoky - S. mutans - S. sobrinus - DNA techniky

Authors: G. Novotná ¹; J. Janata ¹; J. Dušková ²; T. Janatová ²
Authors place of work: Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha ředitelka prof. RNDr. B. Říhová, DrSc. ¹; Výzkumný ústav stomatologický 1. LF UK a VFN, Praha přednostka prof. MUDr. J. Dušková, DrSc. ²
Published in the journal: Česká stomatologie / Praktické zubní lékařství, ročník 105, 2005, 6, s. 170-174

Summary

The authors proposed an algorithm for the analysis of genetic material of oral streptococci, giving significantly more precision to generic identification of bacteria associated with destruction of hard dental tissues. The method based on analysis of parts of the gene for 16S rRNA was verified in laboratory for generic identification of 87 isolates of oral streptococci and correctness of the results was confirmed by the “absolute” method, i.e. by DNA sequencing of the analyzed segment. The proposed procedure can be used in general and the analysis can be extended to other clinically important microorganisms of oral cavity, e.g. bacteria of mucosa associated with the periodontium diseases. The proposed financially modest method makes an unequivocal generic identification possible even for genera, which are difficult to differentiate by biochemical methods. For example it safely differentiates streptococci within the S. mutans group.

Key words:
oral streptococci - S. mutans - S. sobrinus - DNA techniques