Application of Restriction Analysis of the Gene for 16S rRNA for Verification of Species Identity of Important Oral Microorganisms II. Periodontal Microorganisms

České info

Využití restrikční analýzy genu pro 16S rRNA pro ověření druhové identity významných orálních mikroorganismů II. Parodontální mikroorganismy

Autoři navrhují jednoduchý algoritmus analýzy genetického materiálu mikroorganismů sliznice ústní dutiny restrikčními endonukleázami, který významně zpřesňuje druhovou identifikaci bakterií spjatých s onemocněním parodontu. Metodika je založena na analýze části genu pro 16S rRNA, její využití je proto univerzální a lze ji kombinovat s identifikací dalších klinicky významných mikroorganismů ústní dutiny, např. viridujících streptokoků. Metodika je přístrojově i celkově finančně nenáročná, neboť využívá omezený počet restrikčních enzymů. Ačkoliv je cenově srovnatelná s klasickými biochemickými postupy druhové identifikace, rozvíjí je o možnost jednoznačného zařazení mikroorganismů, což je obecný rys molekulárně genetických technik.

Klíčová slova:
mikroorganismy ústní dutiny – parodontální patogeny – DNA techniky

Authors: G. Novotná ¹; J. Janata ¹; J. Dušková ²; T. Janatová ²
Authors place of work: Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha ředitelka prof. RNDr. B. Říhová, DrSc. ¹; Výzkumný ústav stomatologický 1. LF UK a VFN, Praha přednostka prof. MUDr. J. Dušková, DrSc. ²
Published in the journal: Česká stomatologie / Praktické zubní lékařství, ročník 106, 2006, 1, s. 17-21

Summary

The authors recommend a simple algorithm for the restriction-endonuclease analysis of genetic material of microorganisms present on mucous membrane of oral cavity. The method provides a significantly more precise species identification of bacteria associated with diseases of periodontium. The method is based on analysis of the part of the gene for 16S rRNA and its use is therefore universal and may be combined with identification of other clinically important organisms of oral cavity, e.g. viridans streptococci. The requirements of the method for equipment and cost are not high, as it uses a limited number of restriction enzymes. Although the method is comparable with classical biochemical methods as far as the cost is concerned, it represents an improvement due to unequivocal classification of the microorganisms, which is a general feature of molecular-genetic techniques.

Key words:
microorganisms of oral cavity – periodontal pathogens – DNA techniques