Hepatitis B Virus (HBV) Genotypes in the Czech Republic

České info

Genotypy viru hepatitidy B (HBV) v České republice

Genotyp viru hepatitidy B (HBV) byl určen sekvenací a analýzou nukleotidových sekvencí genuS HBV v sérech 176 pacientů s virovou hepatitidou B z celé České republiky. Nejčastěji byl v souboruzjištěn genotyp A u 118 pacientů (67,1 %), dále genotyp D u 50 pacientů (28,4 %). Genotyp B bylnalezen u 6 pacientů (3,4 %) a genotyp C u 2 pacientů (1,1 %). Závislost genotypu A na věku jestatisticky významná, pravděpodobnost výskytu narůstá s věkem. Závislost genotypu A nebo D napohlaví a na lokalitě (kraj) není statisticky významná. Poprvé byly v ČR zjištěny genotypy B a C,které se vyskytují hlavně v jihovýchodní Asii. Nález těchto genotypů jak u cizinců, tak u občanůčeské národnosti svědčí nejen o importu, ale patrně již i o přenosu těchto genotypů v ČR. Fylogenetickáanalýza dokumentuje míru rozdílnosti jednotlivých izolátů HBV. Z odvozených aminokyselinovýchsekvencí bylo určeno i zastoupení subtypových determinant HBV d (68,6 %) a y (31,4 %).Potvrdila se vhodnost sekvenační analýzy genu S pro určování genotypu HBV.

Klíčová slova:
virus hepatitidy B – genotypy – subtypy.

Authors: V. Němeček; O. Strunecký
Authors place of work: Státní zdravotní ústav, Praha
Published in the journal: Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. , 2004, č. 2, s. 55-61
Category:

Summary

Hepatitis B virus (HBV) was genotyped based on sequencing and analysis of nucleotide sequencesof HBV S gene in sera samples from 176 patients with viral hepatitis B from all over the CzechRepublic. The most frequent genotype A was detected in 118 (67.1%) of the patients, followed bygenotype D found in 50 (28.4%) of the patients. Genotypes B and C were identified in 6 (3.4%) and 2(1.1%) of the patients, respectively. The incidence of genotype A statistically significantly increaseswith age. There is no statistically significant correlation between genotypes A and D and gender orlocality (region). Genotypes B and C, found mainly in South East Asia, were first detected in theCzech Republic. Detection of these genotypes in both foreigners and Czech population is suggestivenot only of import but also of transmission of these genotypes in the Czech Republic. Fylogeneticanalysis documents dissimilarity levels betweenHBVisolates. Based on theamino sequencederived,the percentages of HBV subtype determinants d (68.6%) and y (31.4%) were established. The geneS sequencing analysis proved suitable for HBV genotyping.

Key words:
hepatitis B virus – genotypes.

Plné znenie tohto článku nie je v digitalizovanej podobe.

V prípade záujmu kontaktujte NTO ČLS JEP, ktoré vám môže poskytnúť sken časopisu.

Štítky

Hygiene and epidemiology Medical virology Clinical microbiology

Článek MRSADifferentiationamong 752 S. aureus Strains Using a Cefoxitin Disk

Článek Differences in Antibiotic Susceptibility betweenbiofilm Positive and Biofilm Negative Staphylococcus epidermidis Strains Isolatedfrom Blood Cultures

Článek Distribution of Phage Types of Non-typhoidal Salmonella Serovars inthe Slovak Republic in 2000–2003

Článek Multilocus SequenceTyping of Haemophilus influenzae Strains

Článek Survey of AntimicrosporidialAntibodies in Patients with Secondary Immunodeficiency

Článek Bacterial Type III Secretion Systems and their Associationwith Virulence

Článek Viral Hepatitis in Problematic DrugUsers in the Czech Republic

Článok vyšiel v časopise

Epidemiology, Microbiology, Immunology

2004 Číslo 2

Najčítanejšie v tomto čísle