Multilocus SequenceTyping of Haemophilus influenzae Strains
Charakterizace kmenů Haemophilus influenzaemetodou multilokusové sekvenační typizace
Jsou prezentovány první výsledky charakterizace kmenů Haemophilus influenzae novou metodoumultilokusové sekvenační typizace (MLST). Charakterizace souboru 28 kmenů H. influenzae izolovanýchz invazivních onemocnění v České republice ukázala klonální homogenitu těchto kmenů:z 26 testovaných kmenů H. influenzae b vykazovalo 22 kmenů jednotný sekvenční typ: ST-6. U 4kmenů byly zjištěny námi nově popsané sekvenční typy: ST-83 (3 kmeny) a ST-84 (1 kmen). U 2netypovatelných kmenů H. influenzae byly zjištěny jiné sekvenční typy než ST-6: ST-3 a námi nověpopsaný ST-85. První výsledky MLST ukazují, že ST-6 je typický pro H. influenzae b izolovanéz invazivních onemocnění v České republice. Námi nově popsané sekvenční typy ST-83, ST-84 a ST-85byly registrovány v celosvětové databázi MLST H. influenzae (http://haemophilus.mlst.net).
Klíčová slova:
Haemophilus influenzae – multilokusová sekvenační typizace – klonální analýza –sekvenční typ.
Authors:
P. Křížová 1
; J. Kalmusová 1; V. Lebedová 1; J. Felsberg 2; R. Haugvicová 2
Authors‘ workplace:
Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha2Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha
1
Published in:
Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. , 2004, č. 2, s. 74-77
Category:
Overview
First results of multilocus sequence typing (MLST) of Haemophilus influenzae strains are presented.MLST of 28 H. influenzae strains isolated frompatients with invasive diseases in the Czech Republicis indicative of clonal homogeneity of these strains: 22 out of 26 H. influenzae b strains tested wereof the same sequence type, ST-6. Four strains were of two sequence types newly described in thisstudy: ST-83 (3 strains) and ST-84 (1 strain). Two nontypeable H. influenzae strains were assigned tosequence types other than ST-6: ST-3 and ST-85 newly described in this study. First MLST resultsshow ST-6 to be typical of H. influenzae b isolated from patients with invasive diseases in the CzechRepublic. The sequence types newly described in this study, i.e. ST-83, ST-84 and ST-85, weresubmitted to the worldwide H. influenzae MLST database (http://haemophilus.mlst.net).
Key words:
Haemophilus influenzae – multilocus sequence typing – clonal analysis – sequence type.
Labels
Hygiene and epidemiology Medical virology Clinical microbiologyArticle was published in
Epidemiology, Microbiology, Immunology
2004 Issue 2
Most read in this issue
- Bacterial Type III Secretion Systems and their Associationwith Virulence
- Hepatitis B Virus (HBV) Genotypes in the Czech Republic
- Multilocus SequenceTyping of Haemophilus influenzae Strains
- Viral Hepatitis in Problematic DrugUsers in the Czech Republic