Molecular analysis of Fanconi anemia: the experience of the Bone Marrow Failure Study Group of the Italian Association of Pediatric Onco-Hematology

Daniela De Rocco1, Roberta Bottega, Enrico Cappelli, et al. on behalf of the Bone Marrow Failure Study Group of the Italian Association of Pediatric Onco-Hematology (AIEOP)

Department of Medical Sciences, University of Trieste, Italy Clinical and Experimental Hematology Unit, G. Gaslini Children’s Hospital, Genoa, Italy Human Genetics laboratory, “E.O. Ospedali Galliera”, Genoa, Italy et al.

Haematologica 1 June 2014, Vol. 99, No. 6, pp. 1022-1031

Molekulární diagnostika Fanconiho anémie (FA) je relativně komplexní vzhledem ke genetické heterogenitě tohoto onemocnění. Genové mutace byly identifikovány alespoň na 16 různých genech. Tato práce podává výsledky analýzy genových mutací ve 100 rodinách s FA, zařazených do Národní sítě studijní skupiny zaměřené na selhání kostní dřeně Italské asociace pediatrické hematologie a onkologie (National Network of the Marrow Failure Study Group of the Italian Association of Pediatric Hematology and Oncology). Tento soubor tvoří 76 nových rodin a 24 rodin, které byly popsány již v dřívějších publikacích. Přibližně u poloviny případů byl proveden screening mutací po retrovirových komplementačních analýzách nebo proteinové analýze. U druhé poloviny byla provedena analýza zaměřená na nejčastější mutované geny nebo byla použita metoda nové generace sekvenování DNA („next generation DNA sequencing“).

Molekulárně genetické testování u 100 FA probandů dovolilo identifikovat mutace v genech FANCA (n = 85), FANCG (n = 9), FANCC (n = 3), FANCD2 (n = 2) a FANCB (n = 1). Ze všech identifikovaných variant bylo 108 predikováno, že jsou potenciální patogenetické mutace, protože byly uvedeny v databázi FA mutací (n = 62) nebo byly novými variantami (n = 45), neuvedenými v databázi SNP („ single nukleotid polymorphisms“). Většinu mutací činily velké genomické dalece a mutace nonsense nebo mutace posunové („frameshift mutations“), i když autoři identifikovali řadu mutací missense, jejichž patogenetická úloha nebyla vždy jistá. Práce podrobně uvádí výsledky v souvislosti s použitými metodami molekulární diagnostiky, molekulární charakterizacím mutací a predikcí patogenicity. Zavedené strategie nové generace sekvenovaní DNA značně zlepšují diagnostický proces, což dovoluje rychlou analýzu všech genů.

Prof. MUDr. Otto Hrodek, DrSc.