Identifikace určujících regulátorů a role HLA allel
Autoři:
P. Barták
Vyšlo v časopise:
Čas. Lék. čes. 2012; 151: 479
Trans-acting genetické varianty mají významnou, ale spíše náhodnou roli v dědičné determinaci genové exprese. Ve studii byly použity páry čištěných primárních monocytů a B-buněk a přitom identifikovány nové predominantně buněčně specifické typy specific cis a trans exprese quantitative trait loci (eQTLs), včetně multi-locus trans associace LYZ a KLF4 v monocytech a v B buňkách. K tomu byly pozorovány specifické B-buněčné trans asociace rs11171739 at 12q13.2, známý lokus autoimunních chorob s IP6K2 (p = 5,8 × 10-15), PRIC285 (p = 3,0 × 10-10) a upstream region CDKN1A (p = 2 × 10-52), signalizující cyklickou regulaci a peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) nabízející autoimunitní patogenezu. Také byly nalezeny HLA peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) allely z trans asociace s expresí AOAH a ARHGAP24 v monocytech, nikoliv v B-buňkách. Studie ukazuje, že mapování genové exprese v primární buněčné populaci identifikuje nový buněčný typ-specificky trans-regulované sítě a poskytující vhled do genetické báze sklonu k chorobám.
P. Barták
Zdroje
Fairfax BP, et al.: Genetics of gene expression in primary immune cells identifies cell type-specific master regulators and roles of HLA alleles. Nature Genetics 2012; 44: 502–510.
Štítky
Adiktológia Alergológia a imunológia Angiológia Audiológia a foniatria Biochémia Dermatológia Detská gastroenterológia Detská chirurgia Detská kardiológia Detská neurológia Detská otorinolaryngológia Detská psychiatria Detská reumatológia Diabetológia Farmácia Chirurgia cievna Algeziológia Dentální hygienistkaČlánok vyšiel v časopise
Časopis lékařů českých
- Metamizol jako analgetikum první volby: kdy, pro koho, jak a proč?
- Fixní kombinace paracetamol/kodein nabízí synergické analgetické účinky
- Tramadol a paracetamol v tlumení poextrakční bolesti
- Antidepresivní efekt kombinovaného analgetika tramadolu s paracetamolem
- Kombinace metamizol/paracetamol v léčbě pooperační bolesti u zákroků v rámci jednodenní chirurgie
Najčítanejšie v tomto čísle
- Sexuálně přenosné infekce a spermicidy
- XIV. kongres mladých otorinolaryngologů s mezinárodní účastí
- Jak číst kriticky odborné články
- Aktuální koncepce ošetření závažných poranění v Traumatologickém centru Fakultní nemocnice Královské Vinohrady