HLA-DPB1 Gene Analysis in Haematopoietic Stem Cell Transplantations

České info

Analýza HLA-DPB1 genu u transplantací hematopoetických kmenových buněk

Východisko.
Ke genům HLA II. třídy, které ovlivňují transplantaci hematopoetických kmenových buněk, patří pravděpodobně i HLA-DPB1. Cílem studie bylo analyzovat HLA-DPB1 gen a jeho shody/neshody u pacientů transplantovaných od nepříbuzných dárců HSC. Byla použita metoda PCR-SSP.

Metody a výsledky.
Celkově bylo hodnoceno 201 dvojic pacientů a jejich nepříbuzných dárců HSC. Shoda v lokusech HLA-A, -B, -Cw, -DRB1 a -DQB1 (tedy 10/10) byla nalezena u 81 dvojic. U takto shodných dvojic byla provedena genotypizace HLA-DPB1. Celkově bylo v souboru nalezeno 18 různých HLA-DPB1 alel. Z celkového souboru 201 párů byla kompletní shoda 12/12 nalezena pouze u 3 %.

Závěry.
Vzhledem k vysokému stupni neshod a malé dostupnosti předchozích výsledků HLA-DPB1 typizací by snaha o dosažení shody 12/12 výrazně snížila pravděpodobnost nalezení vhodného dárce.

Klíčová slova:
transplantace hematopoetických kmenových buněk, hlavní histokompatibilitní systém, genotypizace alel HLA I. třídy a HLA II. třídy, lokus, polymorfizmus, haplotyp.

Authors: M. Vraná; M. Dobrovolná; P. Cetkovský; S. Nazarová; H. Vondráčková; P. Sedláček ¹
Authors place of work: Ústav hematologie a krevní transfuze, Praha ; Klinika dětské hematologie a onkologie 2. LF UK a FNM, Praha ¹
Published in the journal: Čas. Lék. čes. 2006; 145: 126-129
Category: Original Article

Summary

Background.
The HLA-DPB1 gene is probably one of HLA class II genes affecting the haematopoietic stem cell transplantation. The aim of the study was to analyse the HLA-DPB1 gene and its match/mismatch in patients transplanted from unrelated HSC donors. The PCR-SSP method was used for the typing of the HLA system.

Methods and Results.
The cohort consisted of 201 pairs of patient/unrelated HSC donor. Match in HLA-A, -B, -Cw, -DRB1 and -DQB1 (e.g. 10/10 match) was found in 81 pairs. The HLA-DPB1 was tested in them. 18 different HLA-DPB1 alleles were identified in this cohort. Complete match (e.g.12/12) was detected in 3% of the 201 analysed pairs only.

Conclusions.
The probability of finding 12/12 matching unrelated HSC donor is limited due to the high percentage of mismatches and inaccessibility of previous HLA-DPB1 results.

Key words:
haematopoietic stem cell transplantation, major histocompatibility system, HLA class I and HLA class II genotyping, locus, polymorphism, haplotype.

Štítky

Addictology Allergology and clinical immunology Angiology Audiology Clinical biochemistry Dermatology & STDs Paediatric gastroenterology Paediatric surgery Paediatric cardiology Paediatric neurology Paediatric ENT Paediatric psychiatry Paediatric rheumatology Diabetology Pharmacy Vascular surgery Pain management Dental Hygienist

Článek Cholesterol, Violence and Suicidality – History of Errors

Článek Prenatal Diagnostics of Tuberous Sclerosis Based on Causal Mutation Knowledge

Článek Analysis of Free Foetal DNA in Maternal Plasma Using STR Loci

Článek Increased Risk of Malignancies in Heterozygotes in Families of Patients with Nijmegen Breakage Syndrome

Článek Association of Polymorphic Variants in Endothelin-1 (EDN1) Genes with the Therapy of Patients with Cutaneous T-cell Lymphomas

Článek Pharmacogenetics of Chronic Heart Failure – Beta Blockers

Článek Consultation Activity of Two Slovak Centres for Pharmacotherapy During Pregnancy and Lactation

Článek Recurrent Peripheral Arterial Embolism from Metastatic Lung Choriocarcinoma

Článek History of Medical Genetics in the Czech Republic

Článek Hypertrophic Cardiomyopathy

Článek Frequentational View on the Genome Changes Testing

Článek New Approaches to Haemophilia Treatment – Recombinant and Transgenic Concentrates, Gene Therapy and Engineered Coagulation Factors